Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Msgn1Q9JK54 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Msgn1Q9JK54 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Msgn1Q9JK54 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Msgn1Q9JK54 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Msgn1Q9JK54 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Msgn1Q9JK54 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Msgn1Q9JK54 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Msgn1Q9JK54 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Msgn1Q9JK54 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Msgn1Q9JK54 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Msgn1Q9JK54 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Msgn1Q9JK54 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Msgn1Q9JK54 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Msgn1Q9JK54 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Msgn1Q9JK54 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Msgn1Q9JK54 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Msgn1Q9JK54 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Msgn1Q9JK54 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Msgn1Q9JK54 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Msgn1Q9JK54 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms