Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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