Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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