Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Bco1Q9JJS6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bco1Q9JJS6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bco1Q9JJS6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bco1Q9JJS6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bco1Q9JJS6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bco1Q9JJS6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bco1Q9JJS6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bco1Q9JJS6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bco1Q9JJS6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bco1Q9JJS6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bco1Q9JJS6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Bco1Q9JJS6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Bco1Q9JJS6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Bco1Q9JJS6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bco1Q9JJS6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Bco1Q9JJS6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Bco1Q9JJS6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Bco1Q9JJS6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Bco1Q9JJS6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Bco1Q9JJS6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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Bco1Q9JJS6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Bco1Q9JJS6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Bco1Q9JJS6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bco1Q9JJS6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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