Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms