Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc86Q9JJ89 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc86Q9JJ89 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc86Q9JJ89 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc86Q9JJ89 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc86Q9JJ89 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc86Q9JJ89 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc86Q9JJ89 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc86Q9JJ89 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc86Q9JJ89 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc86Q9JJ89 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc86Q9JJ89 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc86Q9JJ89 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc86Q9JJ89 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc86Q9JJ89 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc86Q9JJ89 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc86Q9JJ89 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc86Q9JJ89 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc86Q9JJ89 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc86Q9JJ89 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc86Q9JJ89 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc86Q9JJ89 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc86Q9JJ89 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc86Q9JJ89 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc86Q9JJ89 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc86Q9JJ89 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc86Q9JJ89 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc86Q9JJ89 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms