Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms