Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG8

Praf2, PRA1 family protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Praf2Q9JIG8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms