Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pus3Q9JI38 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pus3Q9JI38 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pus3Q9JI38 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pus3Q9JI38 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pus3Q9JI38 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pus3Q9JI38 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pus3Q9JI38 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pus3Q9JI38 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pus3Q9JI38 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pus3Q9JI38 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pus3Q9JI38 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pus3Q9JI38 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pus3Q9JI38 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pus3Q9JI38 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pus3Q9JI38 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pus3Q9JI38 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pus3Q9JI38 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pus3Q9JI38 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pus3Q9JI38 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pus3Q9JI38 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pus3Q9JI38 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pus3Q9JI38 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pus3Q9JI38 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pus3Q9JI38 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pus3Q9JI38 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pus3Q9JI38 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pus3Q9JI38 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pus3Q9JI38 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pus3Q9JI38 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pus3Q9JI38 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pus3Q9JI38 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pus3Q9JI38 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms