Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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