Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Cldn19Q9ET38 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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