Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

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Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
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Tm9sf3Q9ET30 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Tm9sf3Q9ET30 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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Tm9sf3Q9ET30 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Tm9sf3Q9ET30 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Tm9sf3Q9ET30 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Tm9sf3Q9ET30 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tm9sf3Q9ET30 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tm9sf3Q9ET30 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tm9sf3Q9ET30 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tm9sf3Q9ET30 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tm9sf3Q9ET30 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tm9sf3Q9ET30 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tm9sf3Q9ET30 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tm9sf3Q9ET30 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tm9sf3Q9ET30 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tm9sf3Q9ET30 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tm9sf3Q9ET30 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tm9sf3Q9ET30 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tm9sf3Q9ET30 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tm9sf3Q9ET30 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tm9sf3Q9ET30 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tm9sf3Q9ET30 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tm9sf3Q9ET30 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tm9sf3Q9ET30 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tm9sf3Q9ET30 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tm9sf3Q9ET30 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tm9sf3Q9ET30 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tm9sf3Q9ET30 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tm9sf3Q9ET30 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tm9sf3Q9ET30 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tm9sf3Q9ET30 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tm9sf3Q9ET30 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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