Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms