Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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