Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms