Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms