Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf23Q9ER63 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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