Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms