Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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