Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQU3

Tlr9, Toll-like receptor 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr9Q9EQU3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr9Q9EQU3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms