Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ28

Pold3, DNA polymerase delta subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold3Q9EQ28 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pold3Q9EQ28 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pold3Q9EQ28 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pold3Q9EQ28 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pold3Q9EQ28 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pold3Q9EQ28 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pold3Q9EQ28 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pold3Q9EQ28 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pold3Q9EQ28 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pold3Q9EQ28 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pold3Q9EQ28 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pold3Q9EQ28 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pold3Q9EQ28 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pold3Q9EQ28 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pold3Q9EQ28 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pold3Q9EQ28 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pold3Q9EQ28 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pold3Q9EQ28 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pold3Q9EQ28 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pold3Q9EQ28 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pold3Q9EQ28 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pold3Q9EQ28 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pold3Q9EQ28 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms