Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SgshQ9EQ08 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms