Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC24■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cpsf1Q9EPU4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cpsf1Q9EPU4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cpsf1Q9EPU4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cpsf1Q9EPU4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cpsf1Q9EPU4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cpsf1Q9EPU4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cpsf1Q9EPU4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cpsf1Q9EPU4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cpsf1Q9EPU4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cpsf1Q9EPU4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cpsf1Q9EPU4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms