Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL5

Mmp1a, Interstitial collagenase A, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1aQ9EPL5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp1aQ9EPL5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms