Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms