Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpne8Q9DC53 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms