Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms