Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB96

Ngdn, Neuroguidin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgdnQ9DB96 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NgdnQ9DB96 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NgdnQ9DB96 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NgdnQ9DB96 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NgdnQ9DB96 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NgdnQ9DB96 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NgdnQ9DB96 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NgdnQ9DB96 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NgdnQ9DB96 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NgdnQ9DB96 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NgdnQ9DB96 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NgdnQ9DB96 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NgdnQ9DB96 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NgdnQ9DB96 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NgdnQ9DB96 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NgdnQ9DB96 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NgdnQ9DB96 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NgdnQ9DB96 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NgdnQ9DB96 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NgdnQ9DB96 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NgdnQ9DB96 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NgdnQ9DB96 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NgdnQ9DB96 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NgdnQ9DB96 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NgdnQ9DB96 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NgdnQ9DB96 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NgdnQ9DB96 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NgdnQ9DB96 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NgdnQ9DB96 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms