Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms