Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TrmuQ9DAT5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TrmuQ9DAT5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TrmuQ9DAT5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TrmuQ9DAT5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TrmuQ9DAT5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TrmuQ9DAT5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TrmuQ9DAT5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TrmuQ9DAT5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TrmuQ9DAT5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TrmuQ9DAT5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TrmuQ9DAT5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TrmuQ9DAT5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TrmuQ9DAT5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TrmuQ9DAT5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TrmuQ9DAT5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TrmuQ9DAT5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TrmuQ9DAT5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TrmuQ9DAT5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TrmuQ9DAT5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TrmuQ9DAT5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TrmuQ9DAT5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TrmuQ9DAT5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TrmuQ9DAT5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TrmuQ9DAT5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TrmuQ9DAT5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TrmuQ9DAT5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TrmuQ9DAT5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TrmuQ9DAT5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TrmuQ9DAT5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TrmuQ9DAT5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TrmuQ9DAT5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TrmuQ9DAT5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TrmuQ9DAT5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TrmuQ9DAT5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TrmuQ9DAT5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TrmuQ9DAT5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TrmuQ9DAT5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TrmuQ9DAT5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TrmuQ9DAT5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TrmuQ9DAT5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TrmuQ9DAT5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms