Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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