Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms