Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms