Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms