Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc52a2Q9D8F3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms