Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl4Q9D8E6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms