Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem54Q9D7S1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms