Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Cldn23Q9D7D7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Cldn23Q9D7D7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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