Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Nop56Q9D6Z1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Nop56Q9D6Z1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Nop56Q9D6Z1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Nop56Q9D6Z1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Nop56Q9D6Z1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Nop56Q9D6Z1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Nop56Q9D6Z1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Nop56Q9D6Z1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Nop56Q9D6Z1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Nop56Q9D6Z1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Nop56Q9D6Z1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Nop56Q9D6Z1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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