Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6N1

Ca13, Carbonic anhydrase 13, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca13Q9D6N1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ca13Q9D6N1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ca13Q9D6N1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ca13Q9D6N1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ca13Q9D6N1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ca13Q9D6N1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ca13Q9D6N1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ca13Q9D6N1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ca13Q9D6N1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ca13Q9D6N1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ca13Q9D6N1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ca13Q9D6N1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ca13Q9D6N1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ca13Q9D6N1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ca13Q9D6N1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ca13Q9D6N1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ca13Q9D6N1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ca13Q9D6N1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ca13Q9D6N1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ca13Q9D6N1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ca13Q9D6N1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ca13Q9D6N1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ca13Q9D6N1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ca13Q9D6N1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ca13Q9D6N1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ca13Q9D6N1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ca13Q9D6N1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ca13Q9D6N1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms