Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms