Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Speer4f1Q9D5Q6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms