Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V7

Rabl3, Rab-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl3Q9D4V7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rabl3Q9D4V7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabl3Q9D4V7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms