Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms