Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms