Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms