Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms