Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gcc1Q9D4H2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms