Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms