Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C1

Lmntd1, Lamin tail domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd1Q9D4C1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms